AGATOS nasce nel 1998, inizialmente in forma di associazione.
Dal 1999 al 2002 partecipa al Piano Territoriale per l’attuazione della legge 285/97 relativo al fondo Nazionale per l’adolescenza. Al piano è interessata l’utenza di nove comuni della provincia di Viterbo, Comune capofila Montefiascone, che l’Associazione segue mediante specifici progetti.
Nel 2002 l’Associazione, ottiene l’accreditamento provvisorio poi trasformato in definitivo della struttura ubicata in Viterbo Via Richiello 4, come Comunità Terapeutica Riabilitativa (SRTRe) Psichiatrica Estensiva, per un totale di 10 posti, e l’autorizzazione regionale all’esercizio per 5 posti per Centro Diurno Psichiatrico. L’Associazione nel 2016, si trasforma in Agatos, Cooperativa Sociale a r.l.